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做好代谢组学研究的关键在哪里?
研究代谢组学的关键是要发展大规模、并行化测定复杂混合体系中代谢物组成信息和对大量数据进行分析和建模的能力。技术手段的发展是代谢组学发展的关键因素。
代谢组学的研究方法：代谢组学研究一般包括代谢组数据的采集、数据预处理、多变量数据分析、标记物识别和途径分析等步骤。生物样品（如尿液、血液、组织、细胞和培养液等）采集后进行生物反应灭活、预处理。
植物营养研究：代谢组学可以用于研究植物对不同营养元素的吸收和利用，为合理施肥提供科学依据。植物药用价值研究：通过分析植物中的代谢物，可以评估其药用价值，为中药开发提供参考。
茶叶品质与安全性的精准评估 借助代谢组学技术，更精确地鉴定茶叶的品质、产地和品种信息。通过建立更加完善的代谢指纹图谱库，实现对茶叶的快速、准确检测。
代谢组学隶属于组学范畴之内，目前关注度颇高，它是了解小分子代谢物质（相对分子质量小于1000）数量、种类、丰度的研究技术，可以对小分子物质进行全面的定性及定量分析，并寻找代谢物与环境因子变化的相对关系。
【代谢组学】3.数据分析
代谢物提取，一般要求每组至少10个样； 在所有提取好的样本中取等量混合作为QC； QC样本与实验样本穿插上机，开始十个QC，结尾三个QC，中间每十个样本穿插一个QC样本 。
这里我们采用基于秩的检验方法，其中基因集富集分析（GSEA）是在转录组数据背景下进行代谢路径分析的一个常见例子，它也可以应用于代谢组数据。
本部分分析内容与常规代谢组学一致，主要针对代谢物含量开展单维与多维统计学分析、KEGG通路分析、表达量相关性分析、聚类热图、代谢物分类等分析。
代谢组学分析如下：代谢组学研究可分为两类：“发现代谢组学”（也称“非靶向代谢组学”）和“靶向代谢组学”。
7.多关联双亲染色体片段代换系(CSSL)群体的代谢组分析
1、本文以三个具有共同轮回遗传背景的染色体片段代换系群体的剑叶为材料，对水稻的代谢多样性进行了分析。
2、最终组装后的基因组大小为994Mb，ContigN50为184 Kb，ScaffoldN50达48 Mb，其中有397条Scaffold组装并锚定到 20条染色体 水平，组装基因组中确定了4991个SNP和874个SSR，并预测出 46430 个蛋白编码基因，重复序列占到整个基因组的59%。
3、为了剖析荔枝果实成熟的调控网络，文章使用72个种质进行了全基因组关联分析（GWAS），发现一个开花相关基因（LITCHI019307）在荔枝中具差异表达。
4、这里有一包含 65 个染色体片段置换系（ chromosome segment substitution line ， CSSL） 的群体 ，产生这一群体的 2 个亲本分别为粳稻 Asominori（背景或轮回亲本） 和籼稻 IR24 （供体或非轮回亲本）。
5、精神分裂症（Schizophrenia）是一组病因未明的精神病，多起病于青壮年，常有感知、思维、情感、行为等多方面的障碍和精神活动的不协调。一般无意识障碍和智力缺损，病程多迁延。
